从1977年第一代DNA测序技术(Sanger法)发展至今三十多年时间,测序技术已取得了相当大的发展,从第一代到第三代,测序读长从长到短,再从短到长。虽然就当前形势看来第二代短读长测序技术在全球测序市场上仍然占有着绝对的优势位置,但第三测序技术也已在这一两年的时间中快速发展着。pacbio的三代测序技术高保真模式下的准确度已经能够和illumina二代测序技术的准确度相媲美,NanoPore开发的便携式测序仪随着其准确度不断的提高未来将会颠覆测序市场。测序仪的每一次变革,也都对基因组研究,疾病医疗研究,药物研发,育种等领域产生巨大的推动作用。

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第二代测序(Next-generation sequencing,NGS)又称为高通量测序,其开创性的引入了可逆终止末端,从而实现边合成边测序,在DNA复制过程中通过捕捉新添加的碱基所携带的特殊标记来确定DNA序列。

二代测序有两个重要特点:1.高通量,二代测序能一次并行对几十、几百万条DNA分子进行测序;2.读长短,测序过程随着读长增长,基因簇复制的协同性降低,会导致测序质量下降,二代测序的读长不超过500bp。因此基因组、宏基因组需要被打断成小片段再测序,测序完毕后再拼接。

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